Mario
Na początku trzeciej sekwencji wujek Ezio mówi „Toż to ja, Mario!” („It’s-a-me! Mario!”), co odnosi się do Braci Super Mario.
Gigantyczna ośmiornica
Można ją znaleźć w Santa Maria Della Visitazione. Ośmiornica pojawia się po aktywowaniu dźwigni przestawiającej elementy w pomieszczeniu. Żeby ją zobaczyć, musisz patrzeć w wodę przy dźwigni przez około minutę. Po tym czasie pojawi się scenka pokazująca, jak tuż obok przepływa wielka ośmiornica. Druga scenka pojawi się po ponownym aktywowaniu dźwigni i spojrzeniu w wodę – Ezio ledwo unika macki. Później stworzenie odpływa.
Strój Altaira
Strój Altaira znany z części 1 można odblokować za 30 punktów Uplay (PC, na konsolach jest dostępny od razu). Nie ma żadnego wpływu na statystyki pancerza. Można nosić go z dowolną peleryną.
Ognisko Próżności
Podczas analizy, co mogło stać się w uszkodzonych sekwencjach pamięci, Shaun opowiada o wydarzeniu we Florencji zwanym Ogniskiem Próżności. (Charyzmatyczny dominikanin, Hieronim Savonarola wygłaszał kazania o upadku i zepsuciu miasta. Po objęciu władzy we Florencji, aby symbolicznie zademonstrować nowy porządek, Savonarola i jego szpiedzy zebrali dzieła kultury medycejskiej Florencji - książki, obrazy, gobeliny, wyszukane meble i ubiory - a następnie ułożyli je w wysoki stos na ognisko próżności na Piazza della Signora. Jednak nie minął rok, jak Savonarola został uznany winnym herezji i zdrady. Spalono go na stosie w tym samym miejscu, w którym niegdyś on sam palił dzieła sztuki.) Rebecca mówi, że uwielbia film De Palmy pod tym samym tytułem. Shaun sarkastycznie odpowiada, że to nie jest właściwy moment na takie komentarze.
Duchy Przeszłości
W sekwencji Ogniska Próżności (13) Ezio może przez krótki czas zobaczyć duchy swojej rodziny. Po spotkaniu z Niccolò Machiavelli wróć do Palazzo Auditore i wejdź na dziedziniec. Ezio zacznie tak jakby używać Orlego Wzroku i zobaczy sylwetki swoich rodziców i bliskich. Kiedy opuścisz to miejsce, wizja zniknie i nie będziesz mógł wywołać jej ponownie. Jeśli ukończyłeś Ogniska Próżności, również niczego nie zobaczysz, więc spróbuj odpowiednio wcześniej.
Palazzo Ducale
Z wykorzystaniem glitcha można dostać się do komnat, gdzie Carlo Grimaldi i Doża grali w szachy. Chociaż świeczka jest zgaszona, to szachy leżą tak samo, jak wtedy, gdy Ezio zabił Grimaldi kilka lat wcześniej.
Narzędzia
Niektóre zwykłe przedmioty mogą zostać użyte jako bronie: miotły, wędki, motyki, widły i grabie.